J’ai eu quelques difficultés à trouver comment changer le thème de ce programme… Et à force de chercher je suis tombé sur la documentation (qui est très mal référencée) que je vous traduis ci-dessous :

Comment changer mon thème GTK+ ?

Depuis la version 2.7.0, Pidgin s’accompagne d’une version intégrée de GTK+ qui n’inclue pas de thèmes supplémentaires ou d’application pour en changer.

Pourtant il existe un moyen de le faire grâce à Alexander Shaduri. Remarque : il n’est pas recommandé d’utiliser l’installeur de GTK+ qu’il distribue, à moins que vous ne saviez ce que vous faites et que vous le fassiez pour de bonnes raisons.

Commencez par télécharger GTK2 Thèmes que vous allez extraire dans un dossier temporaire pour y récupérer les répertoires lib et share que vous allez ensuite placer dans <répertoire d'installation de Pidgin>\Gtk (ils existent déjà donc il faut les ajouter quand même).
Ensuite télécharger GTK2 Prefs que vous allez décompresser dans un dossier temporaire pour récupérer le fichier gtk2_prefs.exe qu’il faudra placer dans le répertoire <répertoire d'installation de Pidgin>\Gtk\bin.

Il ne vous reste plus qu’à exécuter gtk2_prefs.exe et de choisir le thème. Vous voudrez probablement choisir l’option “Apply for all users”, et vous devrez relancer Pidgin pour qu’il applique le nouveau thème.